L’Hospital Sant Joan de Déu de Palma ocupa una superfície de 20.000 metres quadrats. Disposa de 206 llits. Les cures s’estructuren en 5 unitats d’hospitalització, un bloc quirúrgic amb 3 quiròfans, una unitat de pacients crítics i una unitat de cirurgia sense ingrés.

Per realitzar l’activitat rehabilitadora, l’Hospital Sant Joan de Déu de Palma compta amb 2 gimnasos rehabilitadores, un d’ells exclusiu per Neurorrehabilitació, dues sales de grups i una piscina de hidroteràpia amb sòl mòbil. Aquesta unitat disposa també d’una sala de electroteràpia amb diferents boxes per a tractaments individualitzats.

L’Hospital Sant Joan de Déu de Palma compta amb una unitat de radiodiagnòstic i serveis de laboratori i farmàcia.