El Hospital Sant Joan de Déu de Palma ocupa una superficie de 20.000 metros cuadrados. Dispone de 206 camas. Los cuidados se estructuran en 5 unidades de hospitalización, un bloque quirúrgico con 3 quirófanos, una unidad de pacientes críticos y una unidad de cirugía sin ingreso.
Para realizar la actividad rehabilitadora, el Hospital Sant Joan de Déu de Palma cuenta con 2 gimnasios rehabilitadores, uno de ellos exclusivo para neurorehabilitación, dos salas de grupos y una piscina de hidroterapia con suelo móvil. Esta unidad dispone también de una sala de electroterapia con diferentes boxes para tratamientos individualizados.
El Hospital Sant Joan de Déu de Palma cuenta con una unidad de radiodiagnóstico y servicios de laboratorio y farmacia.